Prokaryot hücrelerde (örneğin, bakteriler ve arkeler) bulunmaz.
Memelilerin olgun alyuvar (kırmızı kan hücreleri) hücrelerinde de mitokondri bulunmaz. Çünkü bu hücreler oksijen taşımak için daha fazla alana ihtiyaç duyarlar ve mitokondri bu alanı kaplardı.